لم تكن أزمة جماعة الإخوان الإرهابية مجرد خلاف سياسي مع الدولة أو تنافس على السلطة، وإنما امتدت إلى طبيعة التصورات الفكرية التي حاول التنظيم من خلالها إعادة تعريف المجتمع والعلاقة بين الفرد والسلطة والدين، فقد ارتبط جانب مهم من الأدبيات التي أثرت في بعض تيارات الإسلام السياسي بمفاهيم الجاهلية والحاكمية والطليعة، وهي مفاهيم اكتسبت حضوراً واسعاً في كتابات سيد قطب، أحد أبرز المنظرين الذين ارتبطوا تاريخياً بالجماعة.
وتكمن خطورة توظيف هذه المفاهيم في تحويل الخلاف مع النظم السياسية والمجتمعات القائمة إلى قضية تتجاوز الاختلاف في السياسات، وتصل إلى التشكيك في طبيعة المجتمع نفسه، بما يفتح المجال أمام عقلية ترى أن التغيير لا يتحقق بالمشاركة المتساوية، وإنما بقيادة مجموعة تعتبر نفسها صاحبة الفهم الأكثر اكتمالاً.
وتكمن خطورة توظيف هذه المفاهيم في تحويل الخلاف مع النظم السياسية والمجتمعات القائمة إلى قضية تتجاوز الاختلاف في السياسات، وتصل إلى التشكيك في طبيعة المجتمع نفسه، بما يفتح المجال أمام عقلية ترى أن التغيير لا يتحقق بالمشاركة المتساوية، وإنما بقيادة مجموعة تعتبر نفسها صاحبة الفهم الأكثر اكتمالاً.
